名义上合并的村能分开。依据《农村土地承包法》，土地确权以“户”为基础，户口分开可分开确权，符合法律条例。不及时处理可能导致土地权益纠纷，影响双方合法权益。
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村能分开。操作如下：1. 双方协商，确保无异议；2. 核对土地承包合同，确保地块、亩数一致；3. 向村集体提出申请；4. 经村集体确认后，办理确权手续，确保分开过程合法合规。
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分开的方式需依法进行。应先协商无异议，确保土地承包合同地块、亩数无差异，然后向村集体申请，经确认后办理确权。选择方式时需确保合法合规，避免后续纠纷。